Τα χαρακτικά, αν και αποτελούν αναπόσπαστο κομμάτι της Πινακοθήκης του Ιδρύματος και τη συμπληρώνουν, μπορούν ωστόσο από μόνα τους να συγκροτήσουν μια δεύτερη συλλογή. Σήμερα η συλλογή αυτή αριθμεί περί τα 550 κομμάτια γνωστών ζωγράφων-χαρακτών, αρχίζοντας από τους πρωτοπόρους της ελληνικής χαρακτικής τέχνης, όπως τους Γαλάνη, Κογεβίνα, Θεοδωρόπουλο, Γιαννουκάκη και Κεφαλληνό, συνεχίζοντας με τους μαθητές του τελευταίου Βαρλάμο, Τάσσο, Κατράκη, Γραμματόπουλο κ.ά., και φτάνοντας στους σύγχρονους καλλιτέχνες, όπως οι Δρούγκας, Κομιανού,Τσάρας κ.ά. Συμπληρώνοντας αυτή την πρόχειρη ταξινόμηση, θα πρέπει οπωσδήποτε να αναφερθούν και τα χαρακτικά έργα των Βασιλείου, Τέτση, Τσαρούχη και Χατζηκυριάκου-Γκίκα. Το σχετικά πλούσιο αυτό υλικό έχει τροφοδοτήσει πολλές κινητές εκθέσεις σε πόλεις της Ελλάδας, καθώς και στην Κύπρο.